梁柳(肖聪 饰)哭求皇甫谧(陈浩民 饰)，说明他不想死，让皇甫谧跟皇帝求情，饶他一命。梁柳以天下不能无药为名，让皇甫谧求皇帝，皇甫谧却说明天下医药从不属于独门独派，他们这些寻医问药之人并没有那么重要。皇甫谧的话，让梁柳一时激动，几乎晕过去，皇甫谧只好拿出银针救醒梁柳。梁柳醒过来之后，又一次求皇甫谧，这一次他不再以药典传人的名义求情，而是让皇甫谧心软，看在他的老母无人照顾的份上帮他一把。皇甫谧没有答应梁柳，司马魁(陈继铭 饰)则在隔壁牢房求皇甫谧，让皇甫谧用银针杀死他，免得他要被当众问斩，可皇甫谧却因为自己医者救人身份，没有答应司马魁。皇帝因为丽妃(王泫伊 饰)求情心软，给司马魁下了一道圣旨，赐司马魁一杯毒酒了结，司马魁为此很感激地接受了这个结果，端起毒酒一饮而尽。司马魁死后，皇甫谧便去找王赞通融，因为梁母时日无多，他不忍心让梁母白发人送黑发人，所以求王赞同意，让梁柳回家送梁柳最后一程。梁柳赶回家中，见到了临终前的梁母，他还未来得及跟梁母认错，梁母就抑郁而终了。梁母下葬之后，李明全带着官兵盯着梁柳，要让梁柳自行了断，可没想到梁柳却趁机逃跑了。李明全不敢让皇帝知道梁柳逃跑一事，只能去找皇甫谧帮忙，想利用皇甫谧把梁柳引出来。皇甫谧告诉李明全，梁柳现在最想见的人并不是他，让李明全回宫去好好守着小皇子，一定能引梁柳现身。梁柳闯进了皇宫，先去冷宫带丽妃远走高飞，可丽妃却坚持不肯跟梁柳离开。梁柳跟丽妃说尽了好话，一心表示自己深爱丽妃，可丽妃却耻于再与梁柳为伍，更觉得自己的痛苦全部是由梁柳造成的，也不想自己的孩子长大后还跟梁柳一样，所以怎么也不肯离开。梁柳想要强行带走丽妃，丽妃无奈拿出发簪，用性命威胁梁柳，梁柳这才没有办法先离开。梁柳向丽妃说明，他一定会把自己的孩子带走，也一定会让丽妃后悔不信他，然后便去小皇子寝宫准备劫持小皇子。香苓(王鸥 饰)埋伏在小皇子寝宫，就在皇帝准备看小皇子之时，梁柳突然出现把小皇子给抢走了。梁柳出现，李明全埋伏的人全部动手，想要把梁柳抓拿住，皇帝这才知道梁柳逃跑的事情。香苓与侍卫对梁柳围追堵截，双方进行了激烈的打斗，可梁柳一点也不改变主意，坚持要把小皇子带走。香苓被梁柳打伤了，差点让梁柳一剑刺中，幸好她在千钧一发之际扔出发簪里的银针，让梁柳扑了个空，香苓才有机会反败为胜。香苓将梁柳踢开，砍断了他肩上的包裹布救下了小皇子，而梁柳则不慎被地上的断剑刺中心脏，当场毙命。皇甫谧天天不停地写医书，香苓不明白为何皇甫谧那么着急，只能在一旁帮着皇甫谧。香苓把红囊经、青囊经以及药典全部交给皇甫谧，皇甫谧经过整理也写好了自己的医书，然后把医书交给香苓。香苓不理解，皇甫谧为何要把医书交给她，正对皇甫谧追问之时，得知神针堂被皇帝派人围住了，皇甫谧这才不得不跟香苓说出真相，说明帝王纪事写完之日，就是他归天之期。香苓得知缘由之后，便明白皇甫谧先前所做的那些古怪举动，因此把皇甫谧线臭骂了一顿，然后才跟大家一起想办法，如何逃出神针堂。皇甫谧自知想要从神针堂逃走不易，而传说中的阴阳五行图在御书房内，他也必须进宫把此图找到，所以他提前让侍卫带他进宫，让神针堂解了围。云婉(张墨锡 饰)帮皇甫谧当挡箭牌，拦着要见皇甫谧的李明全，在皇帝着急之时，她不得不上殿假装替皇甫谧宣读帝王纪事的前序，给皇甫谧足够的时间寻找五行图。皇甫谧找到了图，想要离开皇宫之时，在宫门外遭到了侍卫的拦截，幸好香苓及时赶回来帮皇甫谧解决了那些侍卫，将皇甫谧给带走了。皇甫谧和香苓在城外等云婉，迟迟没有看到云婉前来，他们才明白过来云婉是要帮他们离宫而留在了宫中。皇帝得知皇甫谧跑了，生气要下令去捉拿皇甫谧，云婉这才告诉皇帝，皇甫谧在临走前，给皇帝留下了东西。皇帝赶去云婉所说的地点，看到了皇甫谧写的帝王纪事和医书，开心地开怀大笑，便不再管皇甫谧和香苓是否逃脱之事，由着皇甫谧和香苓远走高飞，逍遥自在。（全剧终）